Dienst van SURF
© 2025 SURF
Autoimmune antibody profiling plays a prominent role in both classification and prognosis of systemic sclerosis (SSc). In the last years novel autoantibodies have been discovered and have become available in diagnostic assays. However, standardization in autoimmune serology is lacking, which may have a negative impact on the added value of autoantibodies in diagnosis and prognosis of SSc. In this paper we describe the comparison of commercially available diagnostic assays for the detection of SSc-associated autoantibodies and explored the coexistence of multiple SSc-associated autoantibodies within patients.
LINK
This report presents the highlights of the 7th European Meeting on Molecular Diagnostics held in Scheveningen, The Hague, The Netherlands, 12-14 October 2011. The areas covered included molecular diagnostics applications in medical microbiology, virology, pathology, hemato-oncology,clinical genetics and forensics. Novel real-time amplification approaches, novel diagnostic applications and new technologies, such as next-generation sequencing, PCR lectrospray-ionization TOF mass spectrometry and techniques based on the detection of proteins or other molecules, were discussed. Furthermore, diagnostic companies presented their future visions for molecular diagnostics in human healthcare.
Standard SARS-CoV-2 testing protocols using nasopharyngeal/throat (NP/T) swabs are invasive and require trained medical staff for reliable sampling. In addition, it has been shown that PCR is more sensitive as compared to antigen-based tests. Here we describe the analytical and clinical evaluation of our in-house RNA extraction-free saliva-based molecular assay for the detection of SARS-CoV-2. Analytical sensitivity of the test was equal to the sensitivity obtained in other Dutch diagnostic laboratories that process NP/T swabs. In this study, 955 individuals participated and provided NP/T swabs for routine molecular analysis (with RNA extraction) and saliva for comparison. Our RT-qPCR resulted in a sensitivity of 82,86% and a specificity of 98,94% compared to the gold standard. A false-negative ratio of 1,9% was found. The SARS-CoV-2 detection workflow described here enables easy, economical, and reliable saliva processing, useful for repeated testing of individuals.
LINK
Recent is het vierjarige RAAK project naar de kwaliteitsverbetering van compost voor de champignonteelt afgesloten. Om beter inzicht te krijgen in de compostkwaliteit die aangeleverd wordt bij de telers zijn in het project assay ’s ontwikkeld die kunnen bepalen hoe goed de compost met het mycelium van de champignon doorgroeid is. De compostproducent weet op deze manier dat het goed doorgroeide compost heeft geleverd en dat eventuele oogstvariaties bij de telers een andere oorzaak moeten hebben. In de compost zijn vele micro-organismen (bacteriën en schimmels) aanwezig waarvan het vermoeden is dat ook zij invloed hebben op de kwaliteit van de compost. Om deze reden is in het project tevens onderzoek gedaan naar de samenstelling van de populatie micro-organismen in de verschillende fases van de compostbereiding. Een verandering in de samenstelling, ofwel de verminderde of vermeerderde aanwezigheid van specifieke groepen van micro-organismen, kan mogelijk ook worden gekoppeld aan de oogstresultaten. Op basis van de in het project opgedane kennis zijn Q-PCR assays ontwikkeld om de hoofdrolspelers voor een goede kwaliteit compost te volgen. Voor de uitvoering van dergelijke assays is het van belang dat er uit compostmonsters een uitstekende kwaliteit DNA wordt verkregen. Binnen het project is dit uiteindelijk gelukt, echter de methode is tot nog toe alleen uitgevoerd en gevalideerd tijdens kleinschalige experimenten bij het HAN BioCentre. Gezien de gevoeligheid van de DNA extractie is het van belang dat deze verder wordt geoptimaliseerd en gevalideerd zodat een robuuste methode geïmplementeerd kan worden op het laboratorium van CNC grondstoffen waarbij eigen laboratoriumpersoneel m.b.v. duidelijke protocollen en instructies in staat is om betrouwbare resultaten te halen. De DNA samples zullen gebruikt worden voor Q-PCR analyses maar ook voor nieuwe apparatuur van Austradiagnostics waarmee CNC in compost specifieke pathogenen en andere micro-organismen van interesse kan detecteren. Tevens kan een inzicht in de hoeveelheid beschikbare en ontsloten suikerbronnen (glucose en xylose) in de compost een indicatie geven voor de kwaliteit en de te verwachten oogstopbrengst. Het is van belang om deze bepalingen routinematig uit te kunnen voeren m.b.v. een robuuste methode. Deze analyses zullen eerst opgezet worden bij het HAN BioCentre waarna ze geïmplementeerd kunnen worden op het laboratorium van CNC grondstoffen. CNC beschikt over een beperkt ingericht laboratorium en personeel met een minder gespecialiseerde achtergrond om de analyses uit te voeren. De Top-Up subsidie is nodig om de uiteindelijke implementatie van de hierboven beschreven analyses bij CNC te realiseren waardoor aanlevering van een uitstekende kwaliteit compost bij de vele champignontelers beter gegarandeerd kan worden en de champignonoogst daardoor minder aan variaties onderhevig is en zelfs verhoogd kan worden.